Peptit kararsızlığının nedenlerini anladıktan sonra, peptit sentezinde uzun yıllara dayanan deneyime dayanarak, peptit stabilitesini iyileştirmek için aşağıdaki çözümlerin olduğu doğrulandı.
1) Bölgeye yönelik mutasyon
Peptit kararsızlığına neden olan kalıntıların değiştirilmesi veya genetik mühendisliği yoluyla peptid stabilitesini artıran kalıntıların eklenmesi, peptid stabilitesini iyileştirebilir.
2) Kimyasal modifikasyon
Peptitler için birçok kimyasal modifikasyon yöntemi vardır ve en çok çalışılanı PEG modifikasyonudur. PEG, biyolojik olarak parçalanabilen ve in vivo toksik olmayan, suda çözünebilen bir polimer bileşiğidir. PEG, peptitlerin bağlanma sonrasında çözünürlüğünü artırabilir, biyouyumluluğu düzenleyebilir, termal stabiliteyi artırabilir, proteaz bozulmasına direnebilir, antijenliği azaltabilir ve in vivo yarı ömrü uzatabilir. Uygun modifikasyon yöntemlerinin seçilmesi ve modifikasyon derecesinin kontrol edilmesi, fiziksel uygunluğu iyileştirebilir veya orijinal biyolojik aktiviteyi geliştirebilir.
3) Katkı Maddeleri
Şekerler, polioller, jelatin, amino asitler ve bazı tuzlar gibi katkı maddeleri eklenerek peptidlerin stabilitesi geliştirilebilir. Şeker ve polioller, düşük konsantrasyonlarda proteinleri çevrelemek için daha fazla su molekülünü zorlar, böylece peptitlerin stabilitesi artar. Dondurarak kurutma işlemi sırasında, yukarıda belirtilen maddeler aynı zamanda suyun yerini alabilir ve doğal konformasyonlarını stabilize etmek için peptidlerle hidrojen bağları oluşturabilir ve ayrıca dondurularak kurutulan ürünlerin cam geçiş sıcaklığını da arttırabilir. Ayrıca SDS, Tween, Pluronic gibi yüzey aktif maddeler peptid yüzey adsorpsiyonunu, agregasyonunu ve çökelmesini önleyebilir.
4) Dondurarak kurutma
Peptitlerde meydana gelen deamidasyon, beta eliminasyonu, hidroliz vb. gibi kimyasal reaksiyonlar, diğer reaktanlar için mobil faz görevi de görebilen suyun katılımını gerektirir. Ayrıca su içeriğindeki bir azalma, peptidlerin denatürasyon sıcaklığını arttırabilir. Bu nedenle dondurarak kurutma, peptidlerin stabilitesini artırabilir.