Sözlük

Telefon

+86-0755 2308 4243
Adres

Oda 309, Meihua Binası, Tayvan Endüstri Parkı, No.2132 Songbai Yolu, Bao'an Bölgesi, Shenzhen, Çin
E-posta

sales@biorunstar.com

Sözlük

2-Abz

2-Abz - 2-Aminobenzoil, genellikle 2,4-dinitrofenil (Dnp) veya 3-nitro-tirozin (NitroTyr) ile birleşerek Florofor/Söndürücü çiftleri oluşturur. 320 nm'de uyarma, 420 nm'de emisyon.

3-Abz

3-Abz (m-aminobenzoik asit), bir -amino asit olarak görülebilir. M-aminobenzoik asit peptid zincirlerine dahil edildiğinde sert bir dönüşle sonuçlanır.

4-Abz

4-Doğal olarak oluşan bir benzoik asit türevi olan Abz (p-Aminobenzoik asit, PABA), katı bir doğrusal aralayıcı olarak da kullanılabilir.

Ebu

Abu, L- -Aminobütiril ((S)-2-Amino-bütanoil), -aminobütirik asit, bir amino asit türevidir. Doğal amino asitlere yapısal benzerliğinden dolayı peptitlerin ve peptit mimetiklerinin tasarımında ve sentezinde sıklıkla kullanılır.

Ac asetili temsil eder. N-terminal asetilasyonu, doğadaki peptitler için yaygın bir stabilize edici modifikasyondur.

Acm

Acm, Asetamidometil, Hg(II) veya Ag(I) kullanılarak çıkarılabilir. Çoklu disülfit bağlarına sahip peptitlerin sentezlenmesinde sistein için yaygın olarak kullanılan tiyol koruma gruplarından biridir.

ACTH

ACTH (adrenokortikotropik hormon), ön hipofiz tarafından salgılanan ve adrenal korteksi kortikosteroid üretmesi için uyaran bir hormondur.

Akın

Aad (L- -aminoadipik asit), proteinojenik olmayan bir amino asittir. Yapısı, yan zincirinde ek bir metilen grubu bulunan glutamik asite (Glu) benzer.

AEA (AEA)

(2-Aminoetoksi)asetik asit, aynı zamanda glisin etil ester veya glisin etilamid olarak da bilinir, peptit modifikasyon sentezinde bir aralayıcı veya bağlayıcı olarak kullanılabilir.

Geçici

Peptit sentezinde asit kararsız bir amino koruma grubu olan 1-(1'-adamantil)-1-metil-etoksikarbonilin koruması %3 TFA/CH2Cl2 ile kaldırılabilir

AFC

AFC (7-Amino-4-triflorometilkumarin), salınan kumarinin 395-400 nm'de uyarılmasına, 495-505 nm'de emisyona sahip floresan bir bileşiktir.

Toplama

Daha küçük türlerin kovalent olmayan yapışması nedeniyle daha yüksek molekül ağırlıklı türler oluşur. Özellikle proteinlerde agregasyon, tipik olarak molekül içi etkileşimler oluşturan ve proteinin -helisleri ve -tabakalarına gömülü olanlar gibi ikincil yapılara sahip polar olmayan yüzeylerde meydana gelebilen bir denatürasyon şeklidir. Moleküller birbirleriyle etkileşime girerek bazen çözünmeyen polimoleküler formlar oluştururlar. Agregasyon, yüksek dereceli polimerler oluşturmak için doğru şekilde katlanmış doğal proteinlerin normal etkileşimi olan oligomerizasyonla çelişir.

AHX (Türkçe)

AHX, Aminoheksanoil, 6-amino heksanoik asit, ayrıca Aca veya LC olarak kısaltılır, Tipik olarak biyotin, floroforlar ve peptit dizileri arasına kısa, polar olmayan bir aralayıcı olarak eklenir.

Ayşe

2-Aminoizobütirik asit, pirimidin metabolizmasının son ürünü olan, idrarla atılan ve mantar kökenli bazı antibiyotiklerde bulunan, protein olmayan nadir bir amino asittir. Ayrıca peptit sentezi için doğal amino asitlerin yerine kullanılır.

Alkoller

Alkoller, bir alkil grubu veya hidrokarbon zincirindeki karbon atomuna bağlı bir, iki veya daha fazla hidroksil grubunun (-OH) varlığıyla karakterize edilen organik bileşiklerdir. Peptit alkoller, ilaç keşfi için yapı-aktivite ilişkisi (SAR) çalışmalarında yeterince araştırılmayan, klinik açıdan önemli bileşiklerdir. Örneğin DAMGO, Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol sekansına sahip, C-terminalinde alkolle modifiye edilmiş bir opioid reseptör agonistidir. μ-opioid reseptörüne karşı yüksek seçiciliğe ve afiniteye sahiptir.

Aldehit

Aldehit, karbonil grubunun, karbon zincirinin sonundaki bir karbon atomuna bağlandığı organik bir bileşiktir. Peptit aldehitler, proteazların inhibisyonu ve kimyasal olarak etkisiz hale getirilmesi için biyokimya ve kimyasal biyolojide önemli araçlardır.

Aloc (Aloc Türkçesi)

Aloc - Aliloksikarbonil, amino koruma grubu (aynı zamanda Alloc olarak da kısaltılır). Koruma Pd(PPh3)4 ile kaldırılabilir.

Alzheimer Hastalığı

Amiloid plaklar ve tau düğümleriyle işaretlenen Alzheimer hastalığı, sinaptik işlev bozukluğu ve temizleme yolu sorunlarından kaynaklanır ve bilişsel bozukluğa neden olur.

AMC

7-Amino-4-metilkumarin (AMC), proteaz çalışmalarında peptit etiketlemesi için yaygın olarak kullanılan bir floresan probtur. Bir peptite bağlanması, floresan sinyalini söndürür ve proteaz bölünmesi üzerine salınan AMC, maksimum 345/445 nm'lik uyarılma/emisyon ile enzim aktivitesini ölçebilir. Örneğin, saflaştırılmış proteazomun trypsin benzeri aktivitesinin belirlenmesi için tercih edilen substrat floresan peptidi şu diziye sahiptir: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.

ANP (Milletvekili)

Atriyal natriüretik peptid (ANP), artan kan hacmi ve basıncına yanıt olarak kalbin kulakçıkları tarafından üretilen ve salınan bir hormondur. Vazodilasyonu teşvik ederek, idrar üretimini (diürez) artırarak ve böbreklerde sodyum yeniden emilimini azaltarak sıvı dengesini ve kan basıncını düzenleme işlevi görür. Bu eylemler, yüksek tansiyonun ve vücuttaki aşırı sıvı yükünün etkilerini ortadan kaldırmaya yardımcı olur.

Antijenik peptitler

Antijenik peptitler, bir organizmanın bağışıklık tepkisini tetikleyen proteinlerden veya diğer biyomoleküllerden türetilen kısa amino asit dizileridir. Bu peptitler, bağışıklık sistemi tarafından vücuda yabancı veya yabancı olarak tanınır ve T hücreleri ve B hücreleri gibi bağışıklık hücrelerinin aktivasyonuna yol açar. Antijenik peptitler, adaptif antikor üretimi ve immün hafızanın gelişimi de dahil olmak üzere immün tepkilerde çok önemli bir rol oynar. Patojenlere veya anormal hücrelere karşı spesifik bağışıklık tepkilerini tetikleme potansiyelleri nedeniyle immünoloji ve aşı geliştirmede geniş çapta incelenmektedir.

Asimetrik dallı peptid

2, 4 ve 8 dallı asimetrik peptidlerin sentezi, lizin, arginin veya glutamik asidin peptid dizisine stratejik olarak eklenmesiyle gerçekleştirilebilir.

Asimetrik dimetilarginin (ADMA)

Asimetrik dimetilarjinin (ADMA, Arg(Me)2) doğal olarak oluşan bir kimyasal bileşiktir ve nitrik oksit sentazın (NOS) endojen bir inhibitörüdür. Fmoc-Arg(Me)2-OH (asimetrik), asimetrik dimetilarginin içeren peptitlerin sentezi için doğrudan kullanılabilir.

Ava

5-Aminovalerik asit,peptid modifikasyon sentezinde aralayıcı veya bağlayıcı olarak kullanılabilir.

benziloksimetil

Benziloksimetil (Bom), histidin içeren peptitler için Boc-SPPS işleminde kullanılan, asit kararsız bir imidazol koruma grubudur. Benziloksimetil, asitle muameleden sonra oldukça reaktif formaldehit üretir. Bu nedenle Bom, Cys, metoksiamin veya aldehitlerle reaksiyona giren diğer bileşiklerin varlığında en iyi parçalanandır.

Beta ( )-amino asit

-amino asitlerin amino grupları, karboksil grubundan uzaktaki ikinci karbon atomu olan -karbona bağlanır. Bir -amino asidin genel yapısal formülü şu şekilde temsil edilebilir: R−CH(NH2)−COOH

BNP

B-tipi natriüretik peptid (BNP), kalp kası hücrelerinin aşırı gerilmesine yanıt olarak esas olarak kalbin ventrikülleri tarafından üretilen bir hormondur. Öncelikle vazodilatasyonu teşvik ederek ve böbreklerden sodyum atılımını artırarak kan basıncını ve sıvı dengesini düzenlemede çok önemli bir rol oynar.

Boc

t-Butiloksikarbonil (Boc), peptid sentezinde oldukça asit-labilea-amino koruyucu gruptur, TFA/metilen klorür (1:1), etil asetat veya dioksan içindeki HCl, %98 formik asit ile bölünebilir.

Bpoc (Bilişim Teknolojileri Bilişim

2-(4-Bifenilil)izopropiloksikarbonil (Bpoc), peptid sentezinde oldukça asit kararsız bir -amino koruyucu gruptur ve %1 TFA/metilen klorür ile bölünebilir.

Dallanmış Peptit

2, 4 ve 8 dallı peptitler, peptit dizisine stratejik olarak lizin, arginin veya glutamik asit eklenerek elde edilebilir.

Bsı

t-Butildimetilsilil (TBS veya TBDMS), Fmoc-SPPS ile uyumlu bir hidroksil koruma grubudur. Aside duyarlıdır ve florür iyonları tarafından seçici olarak parçalanabilir.

Bz - Benzoil

Benzoil, sıklıkla peptitlerin N terminaline eklenen bir asil grubudur. Asetilden (Ac) daha az polardır ve kalıcı bir modifikasyon olabilir.

Bzl - Benzil

Benzil (Bzl), peptid sentezinde alkolleri (Ser, Thr, Hyp) bloke etmek için kullanılan bir alkil kalıntısı ve bir yan zincir koruma grubudur. güçlü asitler veya katalitik hidrojenoliz (örn. hidrojen/Pd) yoluyla parçalanabilir.

CCK (İngilizce)

Kolesistokinin (CCK), üst bağırsak mukozası tarafından üretilen ve merkezi sinir sisteminde bulunan bir peptit hormonudur. Safra kesesi kasılmasını, pankreas enzim salınımını uyarır ve çeşitli gastrointestinal süreçleri etkiler.

CGRP (Kamu Yönetimi)

Kalsitonin geniyle ilişkili peptid (CGRP), kalsitonin, amilin ve adrenomedullin ile ilişkili bir 37-amino asit peptididir. Benzer biyolojik aktivitelere sahip -CGRP (CGRP I) ve -CGRP (CGRP II) olmak üzere iki formda bulunur. CGRP öncelikle duyusal ve merkezi nöronlarda bulunur ve kardiyovasküler fonksiyonu, kalsiyum metabolizmasını ve fetoplasental vasküler tonusu etkiler. Reseptörleri G-proteinine bağlıdır ve adenilat siklazı aktive ederek ligand spesifikliği ve hücresel trafik için reseptör aktivitesini değiştiren proteinler (RAMP'ler) ile etkileşime girer.

Ça

L-Sikloheksilalanin (Cha), aromatik halkanın bir sikloheksan halkası ile değiştirildiği, fenilalaninin polar olmayan bir amino asit analoğudur. Bu ikame, deneylerde fenilalanin kalıntılarını Cha ile değiştirerek aromatik amino asitlerin π-π etkileşimleri gibi etkileşimlerdeki rolünün incelenmesine olanak tanır.

ÇG

L- -Sikloheksilglisin (Chg), sterik olarak engellenen, polar olmayan bir amino asittir. Önemli bir farmasötik ara madde olarak hizmet eder ve aynı zamanda doğal ürünlerde de bulunur.

Kolesterol

Kolesterol, karaciğer ve vücuttaki diğer hücreler tarafından doğal olarak üretilir ancak aynı zamanda yediğimiz gıdalardan, özellikle et, kümes hayvanları ve tam yağlı süt ürünleri gibi hayvansal ürünlerden de gelebilir. Farmakokinetiği geliştirmek için kolesterol peptidlere bağlanabilir.

Cis-Hyp (Cis-Hyp)

cis-Hidroksiprolin, doğal trans-hidroksiprolinin stereoizomeri.

Cıt

Sitrulin, arginin kalıntılarının translasyon sonrası enzimatik modifikasyonunun bir sonucu olarak proteinlerde bulunur.

CMK Bilişim Teknolojileri

CMK, FMK'ya benzer güce sahip ancak kimyasal stabilitesi daha düşük olan bir RSK2 kinaz inhibitörüdür.

CNP (Çin Halk Cumhuriyeti)

C-tipi natriüretik peptid (CNP), damar genişletici etkileriyle bilinen, damar endotelyal hücreleri tarafından üretilen bir peptiddir. Atriyal ve beyin natriüretik peptidlerine (ANP ve BNP) yapısal ve fizyolojik benzerlikler gösterir.

CPG

L- -Siklopentilglisil (Cpg), sterik olarak engellenen, polar olmayan bir amino asittir.

C terminali

Peptit dizisinde, amino grubuyla doğrusal diziye bağlanan ve onu serbest bir karboksi grubuyla bırakan benzersiz kalıntı. Bu kalıntının karboksil grubu, amidasyon veya piroglütamat gibi durumlarda dahili laktamizasyon gibi modifikasyonlara maruz kalabilir.

Cy3

Siyanin 3, genellikle 558 nm civarında bir ışık kaynağı tarafından uyarılan ve yaklaşık 572 nm'de ışık yayan kırmızı floresan bir siyanin boyasıdır.

Cy5

Siyanin 5, genellikle 646 nm civarında bir ışık kaynağı tarafından uyarılan ve yaklaşık 664 nm'de ışık yayan yakın kızılötesi floresans yayan bir siyanin boya floroforudur.

Dab

L-, -Diaminobutirik asit, ornitin (Orn) ve lisinin (Lys) daha kısa bir analoğu olan bir ,ω-diamino asittir. Uygun korumayla, ω-diamino asitler, Nω konumlarında seçici olarak değiştirilebilir veya dallanmış peptidler veya dendrimerler oluşturmak üzere birleştirilebilir.

DABCİL

3-(Dimetilaminoazo)benzen-4-karboksilik asit, biyokimya ve moleküler biyoloji uygulamalarında floresans rezonans enerji transferinde (FRET), örneğin EDANS ile söndürücü olarak kullanılan amino gruplarına bağlı bir kromofordur. DABCYL'nin 454 nm'de uyarılması.

Dabsil

Dabsyl,4-dimetilaminobenzensülfonil klorür, örneğin EDANS ile kombinasyon halinde söndürücü olarak kullanılan amino gruplarına bağlı bir kromofor. Dabsyl'in 436 nm'de uyarılması.

DANSIL

4-Dimetilamino-1-naftalen-sülfonil, amino gruplarına bağlı bir florofor, 342 nm'de uyarılma, 562 nm'de emisyon.

Dap

L-, -Diaminopropiyonik asit (Dap veya Dpr), diaminobütirik asit (Dab), ornitin (Orn) ve lisinin (Lys) daha kısa bir analoğu olan bir ,ω-diamino asittir. ω-diamino asitlerin modifiye edilmiş türevleri, Nω pozisyonlarında seçici olarak değiştirilebilir veya dallanmış peptidler veya dendrimerler oluşturmak için dahil edilebilir.

Dde

1-(4,4-Dimetil-2,6-dioksosikloheks-1-iliden)etil (Dde), peptid sentezinde kullanılan bir amino koruyucu gruptur. Dimetilformamid (DMF) içerisinde %2 hidrazin hidrat kullanılarak seçici olarak bölünebilir. Nω-Dde, Fmoc katı fazlı peptid sentezinden (SPPS) sonra Dde'nin Dap, Dab, Orn veya Lys gibi amino asitlerden spesifik olarak uzaklaştırılmasına izin vererek Nω-amino grubunun reçine üzerinde modifikasyonunu kolaylaştırır.

Disülfür

Disülfür bağları, proteinlerdeki sistein kalıntılarının iki sülfhidril (-SH) grubu arasında oluşan kovalent bağlardır.

Öğr.

2,4-dimetoksibenzil, peptid sentezinde tersinir omurga modifikasyonu için kullanılan, asitte kararsız bir formamid koruma grubudur. Katı fazlı peptid sentezi (SPPS) sırasında amino asit veya dipeptit Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH) olarak dahil edilirler; burada Fmoc, peptid toplanmasını önler ve dolayısıyla etkili uzamayı destekler. Dmb ayrıca siklizasyon reaksiyonlarını teşvik eder ve asparagimid oluşumunu önler. Hmb türevlerinin aksine Dmb, aktivasyon sırasında benzoksazepinler oluşturmaz.

Dnp - 2,4-Dinitrofenil

2,4-Dinitrofenil, amino gruplarına konjuge olan bir kromofordur ve genellikle floresans rezonans enerji transferi (FRET) substratlarında söndürücü olarak kullanılır.

Dod

Bis-(4-metoksifenil)metil olarak da bilinen 4,4'-Dimetoksiditil, Fmoc katı fazlı peptid sentezi (SPPS) ile uyumlu, asit kararsız bir karboksamid koruma grubudur.

DOPA (Türkçe)

DOPA, 3,4-dihidroksifenilalanin, dopamin, norepinefrin ve epinefrin dahil olmak üzere birçok önemli nörotransmiterin öncüsüdür.

DOTA (Türkçe)

DOTA olarak kısaltılan (4,7,10-Trikarboksimetil-1,4,7,10-tetraazasiklododesil)-asetik asit, tipik olarak peptitlerin N terminaline bağlanan siklik bir şelatördür. DOTA, görüntüleme ve hedefe yönelik tedavi de dahil olmak üzere çeşitli biyomedikal uygulamalar için peptitlerin 68Ga veya 90Y gibi radyonüklitlerle etiketlenmesini kolaylaştırır.

Dpm

Difenilmetil (ditil), asitte kararsız bir N-, O- ve S-koruyucu grup.

DTPA (DTPA)

Dietilentriaminpentaasetik asit (DTPA), nükleer tıp görüntülemeye uygulanabilen (68)Ga, (99m)Tc ve (111)In gibi radyonüklidler için faydalı bir şelasyon maddesidir.

EDANS (İngilizce)

5-[(2-Aminoetil)amino]naftalin-1-sülfonik asit (EDANS), genellikle lizin gibi diamino asitlerin Nω'sine bağlı bir florofordur. FRET substratlarında sıklıkla kullanılır ve tipik olarak DABCYL gibi söndürücülerle eşleştirilir. EDANS, 340 nm'lik bir uyarılma dalga boyuna sahiptir ve 490 nm'de yayar.

EMAP (Yapay Zeka)

Endotel monosit aktive edici polipeptit.

Bir alkil grubu ve metil (Me) homologu olan etil, peptidlerde kalıcı N- ve S-etilasyon modifikasyonları için kullanılır.

Epitop haritalaması

Epitop haritalaması (antijen epitop haritalaması), bir antijen üzerindeki antikorlar veya bağışıklık sistemi tarafından tanınabilen spesifik alanları (yani antijen epitoplarını) belirlemek için kullanılan bir tekniktir. Antijen epitopları doğrusal epitoplara ve konformasyonel epitoplara bölünebilir. Antijen epitop haritalaması yoluyla, aşı geliştirmede, hastalık teşhisinde, immünoterapide ve diğer yönlerde büyük önem taşıyan antijenin yapısı ve işlevi arasındaki ilişkiyi derinlemesine anlayabiliriz.
Yaygın olarak kullanılan bazı antijen epitop haritalama yöntemleri şunları içerir:
X-ışını kristalografisi: Antijenin üç boyutlu yapısını doğrudan analiz edebilir, böylece epitopun konumunu belirleyebilir.
Nükleer manyetik rezonans: Epitopu belirlemek amacıyla antijenin yapısını analiz etmek için de kullanılabilir.
Peptid tarama tekniği: Antikora bağlanan epitopu tanımlamak için bir dizi örtüşen sentetik peptid segmentinin kullanılması.
Örneğin aşı araştırma ve geliştirmesinde, antijen üzerindeki anahtar epitopların açıklığa kavuşturulması, daha etkili aşıların tasarlanmasına ve daha hedefe yönelik bir bağışıklık tepkisinin tetiklenmesine yardımcı olur; Hastalık teşhisinde spesifik hastalıklara ilişkin antijen epitoplarının belirlenmesi daha doğru teşhis reaktiflerinin geliştirilmesini sağlayabilir.

5-FAM

5-FAM (5-Karboksifloresein), biyomolekülleri etiketlemek için yaygın olarak kullanılan, 490 nm'lik bir uyarılma dalga boyuna ve 520 nm'de emisyona sahip bir florofordur.

6-FAM

Floresein-6-karbonil, amino gruplarına bağlı, 490 nm'lik bir uyarılma dalga boyuna ve 520 nm'de emisyona sahip bir florofordur.

FITC (Finans Finans Kurumu)

Floresein izotiyosiyanat (FITC), amino gruplarıyla reaksiyona giren bir florofordur. Bir peptidi N-terminalinde FITC ile etiketlerken, genellikle -alanin veya Ahx gibi bir aralayıcı eklenir. FITC, 490 nm'lik bir uyarılma dalga boyuna ve 520 nm'de emisyona sahiptir.

9-Florenilmetil, O- ve S-koruma için kullanılan, baza kararsız bir koruma grubudur.

FMK

FMK, florometil keton, RSK2 kinazın geri döndürülemez bir inhibitörüdür.

Fmoc (Fmoc)

9-Fluorenilmetoksikarbonil (Fmoc), FMOC katı faz sentezindeki amino koruma grubu, %20 piperidin/DMF ile çıkarılabilir.

İçin

Formil, Boc-SPPS'de kullanılan bir indol koruma grubudur. Trp(For), bir merkaptan varlığında HF veya piperidin gibi bazlar tarafından bölünür.

Hüzün

Floresan rezonans enerji transferi (FRET), ışınımsız enerjinin uyarılmış bir florofordan (donör) uygun bir alıcıya (söndürücü) aktarılmasıdır. Transfer, verici ve alıcının mesafesine, dipol yönelimine ve spektral örtüşmesine bağlıdır. FRET substratlarında florofor ve söndürücü, bir peptid zinciri aracılığıyla bağlanır. Enzimatik bölünme, donör ve alıcıyı ayırarak floresansı arttırır.

Floresan

Floresan, ışığı veya diğer elektromanyetik radyasyonu emen bir maddenin yaydığı ışıktır. Bu, florofor adı verilen moleküllerin belirli bir dalga boyundaki fotonları absorbe etmesi, uyarılması ve ardından fotonları yayması ve temel durumlarına geri dönmesiyle meydana gelir. Yayılan ışık tipik olarak emilen ışıktan daha uzun bir dalga boyuna ve daha düşük enerjiye sahiptir, bu da karakteristik bir floresans spektrumuyla sonuçlanır. Bu fenomen, mikroskopi, akış sitometrisi ve floresans spektroskopisi dahil olmak üzere çeşitli bilimsel ve tıbbi amaçlar için yaygın olarak kullanılmaktadır.

GIP

Glukoza bağımlı insülinotropik peptit olarak da bilinen gastrik inhibitör polipeptit (GIP), sekretin hormon ailesine aittir. İnsülin sekresyonunu uyarır, mide asidi sekresyonunu inhibe eder ve insülin sekresyonunun ve glukoz homeostazisinin düzenlenmesinde önemli bir rol oynar.

Gla

L- -Karboksiglutamik asit (Gla), glutamik asidin translasyon sonrası karboksilasyonu yoluyla oluşturulur ve bunun sonucunda osteokalsin gibi kalsiyum iyonlarını bağlayabilen proteinler elde edilir. Gla içeren peptitler ideal olarak Fmoc katı fazlı peptit sentezi (SPPS) kullanılarak sentezlenir, çünkü Gla güçlü asitlerin varlığında glutamik asit elde etmek için dekarboksilasyona uğrayabilir.

GLP (Türkçe)

Glukagon benzeri peptitler, proglukagonun C-terminal bölgesinden türetilen peptit hormonlarının glukagon süper ailesinin üyeleridir. Esas olarak bağırsak L hücreleri tarafından sentezlenirler.

GnRH (İngilizce)

Gonadotropin salgılayan hormon (LHRH), hipotalamik nörosekretuar hücrelerde üretilen ve pulsatil patlamalarla hipofiz portal dolaşımına salınan bir dekapeptit hormondur. Pulsatil sekresyon üreme fonksiyonları, cinsel gelişim ve farklılaşma için kritik öneme sahiptir.

GİF

Somatorelin olarak da bilinen büyüme hormonu salgılayan hormon (GHRH), hipofiz bezini büyüme hormonunu salgılaması ve sentezlemesi için uyaran hipotalamik bir peptit hormonudur.

CTP

Somatorelin olarak da bilinen büyüme hormonu salgılayan hormon (GHRH), hipofiz bezini büyüme hormonunu salgılaması ve sentezlemesi için uyaran hipotalamik bir peptit hormonudur.

HLA (HLA)

İnsan lökosit antijeni (HLA), hücrelerin yüzeyinde bulunan ve bağışıklık sisteminin yabancı maddeleri tanımasında önemli bir rol oynayan bir grup proteini ifade eder. Bunlar insanlarda majör doku uyumluluk kompleksi (MHC) genleri tarafından kodlanırlar ve antijenlerin T hücrelerine sunulması için gereklidirler ve bağışıklık sisteminin kendi hücreleri ile kendi olmayan hücreleri ayırt etmesini sağlarlar. HLA molekülleri oldukça çeşitli ve polimorfiktir; bireysel bağışıklık tepkilerine, otoimmün hastalıklara ve organ reddine karşı duyarlılığa önemli ölçüde katkıda bulunur.

Hmb

2-hidroksi-4-metoksibenzil, peptit sentezinde tersinir omurga modifikasyonu için kullanılan, asitte kararsız bir formamid koruma grubudur. Katı fazlı Fmoc peptid sentezi (SPPS) sırasında bir amino asit veya Fmoc-Hmb dipeptidi (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) olarak dahil edilir, agregasyonu önler ve verimli peptid uzantısını mümkün kılar. Hmb ayrıca siklizasyon reaksiyonlarına yardımcı olur ve asparajin oluşumunu önler.

Har

L-Homoarginin, Har olarak kısaltılan L-arginin'in bir homologudur ve plazmada ve idrarda bulunabilir. Homoarjinin, lizinin peptitler ve proteinler üzerinde de gerçekleştirilebilen guanidinasyonunun sonucudur.

HCI (Öğr)

Homositrülin, Hci olarak kısaltılan L-sitrulin'in bir homologudur ve insan idrarında tespit edilebilir.

Hcy (Türkçe)

L-homosistein, Hcy olarak kısaltılan bir sistein homologudur ve metioninin demetilasyonuyla üretilir. Yüksek kan Hcy düzeyleri kardiyovasküler ve nörodejeneratif hastalıklar için bir risk faktörüdür. Cys türevlerinin aksine, Hcy türevleri bağlanma sırasında rasemize olmaz ve -elimin de yapmaz.

Hle

Hle olarak kısaltılan L-lösin homologları.

Hph olarak kısaltılan fenilalanin homologu olan homofenilalanin, ACE ve renin inhibitörlerinin bir bileşenidir. Fmoc-Homophe-OH potansiyel bir antiinflamatuar ilaçtır.

Pip veya Hpr olarak kısaltılan L-homoprolin veya L-pikolik asit. Prolin homologu Hpr, L-lizinin bir bozunma ürünüdür. Her iki enantiyomer de insan plazmasında tespit edilebilir. Prolin kalıntıları peptidin konformasyonunu güçlü bir şekilde etkilediğinden, Pro'nun Hpr (veya azetidin-2-karboksilik asit (Aze)) ile değiştirilmesi ikincil yapısını modüle edebilir.

heyecan

L-transhidroksiprolin, prolinin oksidasyonu ile translasyon sonrası olarak üretilir. Hip, kolajen ve midye proteininin önemli bir bileşenidir.

izoserin

L-serinin bir izomeri olan izoserin, bir -amino asittir.

IvDde

Bir amino koruma grubu olan ivDde'nin koruması kaldırılabilir ve DMF içindeki %2 hidrazin hidrat ile bölünebilir. ivDde, Fmoc-SPPS sırasında sık sık çoklu piperidin tedavilerine karşı Dde'den daha stabildir. Nω-ivDde, Dap, Dab Orn veya Lys'den seçici olarak çıkarılabilir ve Nω-amino grubunun sentetik sonrası reçine üzerinde modifikasyonuna izin verir.

KLH

Anahtar deliği limpet hemosiyanin (KLH), dev anahtar deliği limpet hemosiyanininin hemolenfinde bulunan büyük, oksijen taşıyan çok alt birimli bir metaloproteindir. Bir antijen taşıyıcısı olarak KLH genellikle hedef polipeptit dizilerini birleştirerek immünojeniteyi ve antijen sabitleme yeteneklerini geliştirir, etkili, spesifik ve fonksiyonel antikorların oluşumunu önemli ölçüde teşvik eder.

LHRH

Luteinize edici hormon salgılayan hormon (LHRH veya GnRH), hipotalamustaki nörosekretuar hücreler tarafından sentezlenen ve pulsatil olarak hipofiz portal dolaşımına salınan bir dekapeptit hormondur. Pulsatil sekresyon üreme fonksiyonu, cinsel gelişim ve farklılaşma için kritik öneme sahiptir.

Bağlayıcı

Peptit tasarımı ve sentezinde araştırmacılar, biyotin veya floresan ile peptitler arasına bir bağlayıcı ekleyebilirler. Yaygın bir hidrofobik ayırıcı, aminoheksanoik asittir (Ahx) ve yaygın bir hidrofilik ayırıcı, poli(etilen) glikoldur (PEG).

Liyofilize

Isıya duyarlı malzemelerden sıvıyı uzaklaştıran dondurarak kurutma işlemi. Malzeme dondurulur, yüksek vakum altına yerleştirilir ve düşük sıcaklıklarda tutulur. Vakumun yarattığı basınç, buzun sıvı durumdan geçmeden katı durumdan gaz durumuna geçmesine neden olur. Peptitler genellikle liyofilize toz halinde teslim edilir.

LC-MS (Türkçe)

Sıvı Kromatografisi-Kütle Spektrometrisi, karmaşık numuneler içindeki moleküllerin bileşimi ve yapısı hakkında ayrıntılı bilgi sağlamak için sıvı kromatografiyi kütle spektrometrisiyle birleştiren çok yönlü bir analitik tekniktir.

HARİTALAR

Çoklu Antijenik Peptitler. Çoklu Antijenik Peptit, yüksek titreli anti-peptit antikorları ve sentetik peptit aşıları üretmenin güçlü bir yoludur.

MALDI-MS

Matris Destekli Lazer Desorpsiyon/İyonizasyon Kütle Spektrometresi (MALDI-MS), iyonların kütle-yük oranını ölçmek için kullanılan analitik bir tekniktir. Peptitler, proteinler ve polimerler gibi biyomoleküllerin analizi için özellikle faydalıdır.

Kütle Spektrometresi

Kütle spektrometrisi (MS), iyonların kütle-yük oranını (m/z) ölçmek için kullanılan güçlü bir analitik tekniktir.

4M Yok

MNA olarak kısaltılan 4-Metoksi- -naftilamid, genellikle C terminalinde bir karboksipeptidaz substratına bağlanan bir florofordur. Bölünmüş 4M NA, 335-350 nm'de uyarılır ve 410-440 nm'de yayar

Mb/sn

Metoksibenzensülfonil (Mbs), Boc bazlı katı fazlı peptid sentezinde (Boc-SPPS) kullanılan bir guanidil koruma grubudur. Bu koruma grubunun koruması, hidrojen florür (HF) ile bölünme yoluyla kaldırılabilir.

Mbzl

4-Metilbenzil (Mbzl), Boc bazlı katı fazlı peptid sentezinde (Boc-SPPS) kullanılan bir sülfhidril koruma grubudur. Mbzl, sık trifloroasetik asit (TFA) muameleleri altında metoksibenzilden (Mob) daha stabildir ve hidrojen florür (HF) bölünmesiyle uzaklaştırılabilir.

Maca

(7-Metoksikumarin-4-il)asetik asit (Mca), bir amino grubuna bağlanabilen bir florofordur.
Mca, floresans rezonans enerji transferi (FRET) substratları için dinitrofenile (Dnp) bağlanır. Uyarma dalga boyu 325 nm ve emisyon dalga boyu 392 nm'dir.

MCH

Melanin konsantre edici hormon (MCH), ilk olarak balıklardan ve sıçanlardan izole edilen siklik bir nöropeptittir. MCH öncelikle teleost balıklarda cilt pigmentasyonunun düzenlenmesinde ve memelilerde beslenme davranışında rol oynar.

Ben

En basit alkil ikame edicisi olan metil, peptidin kalıcı modifikasyonlarını oluşturan N-, O- ve S-metilasyonda rol oynar.

MeOSuc

3-Deaminlenmiş Asp(OMe)'ye karşılık gelen metoksisüksinil, genellikle karboksipeptidaz substratlarına dahil edilen bir polar N-terminal bloklama grubudur.

Metilasyon

Metilasyon, bir metil grubunun (-CH3), genellikle lizin (Lys), arginin (Arg), histidin (His) veya glutamat gibi spesifik amino asit kalıntılarına enzimatik olarak eklendiği peptitlerin ve proteinlerin translasyon sonrası bir modifikasyonudur (PTM). Glu). Bu modifikasyon, protein fonksiyonunu, stabilitesini ve diğer moleküllerle etkileşimlerini önemli ölçüde etkileyebilir, böylece gen ekspresyonu, sinyal iletimi ve protein-protein etkileşimleri dahil olmak üzere çeşitli hücresel süreçlerin düzenlenmesinde önemli roller oynayabilir.

MHC (Mali İşler T

Ana doku uyumluluk kompleksi (MHC), MHC moleküllerini kodlayan genleri içeren genetik bir bölgedir. Bu moleküller bağışıklık sisteminde ve otoimmünitede çok önemli bir rol oynar. İnsanlarda bu kompleks aynı zamanda insan lökosit antijeni (HLA) sistemi olarak da bilinir.

MHC ben

MHC sınıf I (MHC I) molekülleri, hücrenin içinden sitotoksik T hücrelerine peptitler sunan hücre yüzeylerindeki proteinlerdir. Bu, bağışıklık hücrelerinin, patojenlere ve kansere karşı bağışıklık savunması için çok önemli olan enfekte veya anormal hücreleri tanımasına ve yok etmesine yardımcı olur.

MHC II

MHC sınıf II (MHC II) molekülleri, yabancı maddelerden türetilen peptitleri yardımcı T hücrelerine sunan hücre yüzeyi proteinleridir. Bu etkileşim, bağışıklık tepkilerini koordine etmek ve diğer bağışıklık hücrelerini patojenlere karşı aktive etmek için gereklidir.

Mono-metilasyon arginin

Monometillenmiş arginin (MMA), bir peptit veya protein içindeki bir arginin kalıntısının guanidino nitrojenine tek bir metil grubunun (-CH3) enzimatik olarak eklendiği bir translasyon sonrası modifikasyondur.

Mpa

3-merkaptopropilamin, çeşitli biyokimyasal ve biyomedikal uygulamalarda bir peptit ligandı veya değiştirici olarak kullanılabilir.

Fransa

Miristoyilasyon, bir 14-karbon doymuş yağ asidinden oluşan bir miristoil grubunun, peptidin N terminaline kovalent olarak bağlandığı bir lipit modifikasyon işlemidir. Bu modifikasyon, proteinin hücre zarına sabitlenmesine hizmet ederek lokalizasyonunu ve çeşitli hücresel süreçlere katılımını kolaylaştırır.

1-Nal

-(1-naftil)-L-alanin, fenilalanine benzer, ancak bir fenil grubu yerine bir naftil grubuna sahip, polar olmayan bir amino asit türevidir.

2-Nal

-(2-Naftil)alanin, fenilalanine benzer, ancak bir fenil grubu yerine bir naftil grubuna sahip, polar olmayan bir amino asit türevidir.

NBD (Türkçe)

3-nitrobenz-2-oksa-1, 3-diazol (NBD), genellikle NBD-Cl reaktifinin peptite bağlanmasıyla eklenir. NBD etiketli peptitler, membranlara ve hücre biyolojisine odaklanan çalışmalarda kullanımları nedeniyle yaygın olarak seçilmektedir.

NHEt

N-Etilamid, C-terminal alaninin dekarboksillenmiş bir formu olarak düşünülebilir. LHRH agonisti buserelin'de NHEt, C-terminal glisinamidin bir analoğu olarak görev yapar. Peptit N-etilamid, karboksipeptidazlar tarafından parçalanmaya karşı dirençlidir.

Nle

L-norlösin (Nle), L-metiyoninin stabil bir izosteridir. Bir peptidin biyolojik aktivitesi sülfoksit oluşumu nedeniyle tehlikeye girdiğinde, Nle, tipik olarak fonksiyonel davranışını değiştirmeden Met'in yerine kullanılabilir.

NOT

NOTA, 1,4,7-triazasiklononan-1,4,7-triasetik asit, PET görüntüleme araçlarının oluşturulması için bir çerçeve görevi gören iki işlevli bir şelatördür. Aynı zamanda prob tasarımında ve multivalent etkiler yoluyla sinyal amplifikasyonunda da kullanılır ve teşhis amaçlı galyum radyofarmasötiği olarak potansiyel uygulamalara sahiptir.

N-Ben

N-Me genellikle N-Me-Gly, N-Me-Ser, N-Me gibi moleküldeki bir nitrojen atomuna bir metil grubunun (-CH3) bağlandığı kimyasal bir modifikasyon olan N-metilasyonu ifade eder. -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me -Val , N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva, vb.

NODAĞA

NODAGA,1,4,7-triazasiklononan,1-glutarik asit-4,7-diasetik asit, organometalik radyofarmasötiklerin tasarımı ve geliştirilmesi için olağanüstü bir iki işlevli şelatördür ve önemli avantajlar sunar. tanısal görüntüleme ve hedefe yönelik radyoterapi uygulamaları için potansiyel.

Nps (Nükleer Santral)

2-Nitrofeniltiyo (Nps), Boc bazlı katı fazlı peptit sentezinde (Boc-SPPS) kullanılan bir S-koruyucu gruptur. Tiyoller tarafından, özellikle sisteinin serbest sülfhidril grubu (Cys) aracılığıyla parçalanabilir ve bu da eş zamanlı bir disülfid bağı oluşumuna yol açar.

NPY (NPY)

Nöropeptit Y (NPY), beyinde öne çıkan bir nöropeptittir ve pankreas polipeptiti (PP) ve peptid YY'yi (PYY) içeren nöropeptit Y ailesinin bir parçasıdır.

Npy'ler

2-Nitro-2-piridilsülfenil (Npys), Boc bazlı katı fazlı peptit sentezi (Boc-SPPS) ile uyumlu bir S-koruyucu gruptur. Npys, tiyoller tarafından, özellikle sisteinin serbest sülfhidril grubu (Cys) yoluyla bölünebilir ve bu da eş zamanlı bir disülfür bağı oluşumuyla sonuçlanır.

Nva

Norvalin, polar olmayan bir alifatik amino asittir ve -aminobütirik asidin (Abu) bir homologudur.

Yok

-Naftilamid, karboksipeptidaz substratlarında yaygın olarak kullanılan ve tipik olarak peptidlerin C terminaline bağlanan bir florofordur. Bölünmüş NA, 330 nm'de uyarılır ve 370 nm'de yayar.

Yok

-Naftilamid, karboksipeptidaz substratlarında yaygın olarak kullanılan ve tipik olarak peptidlerin C terminaline bağlanan bir florofordur. NA 320-340 nm'de yarılmış, emisyon 410-420 nm'de.

OHepsi

Alil ester, hem Fmoc hem de Boc bazlı katı fazlı peptid sentezi (SPPS) ile uyumlu bir karboksil koruma grubudur. Aloc'a benzer şekilde alil esterler, Pd(PPh3)4 ile işleme tabi tutularak seçici olarak çıkarılabilir. Fmoc-SPPS'de Asp(OAll), baz katalizli aspartimid oluşumuna karşı hassastır.

OBzl

Bir karboksil koruma grubu olan benzil ester, katalitik hidrojenasyon (örn. H2/Pd) veya güçlü asitlerle çıkarılabilir.

OcHex (OcHex)

OcHex, Boc bazlı katı fazlı peptid sentezinde (Boc-SPPS) kullanılan standart karboksil koruma grubudur.

ODmab

4-(N-[1(4,4-Dimetil-2,6-dioksosikloheksiliden)-3-etilbütil]amino)benzil ester (ODmab), bir karboksil koruyucudur Fmoc bazlı katı fazlı peptid sentezinde (Fmoc-SPPS) kullanılan grup. DMF içinde %2 hidrazin hidrat kullanılarak bölünebilir ve koruması kaldırılabilir.

ODmb

2,4-Dimetoksibenzil ester, diklorometan içinde %1 TFA kullanılarak çıkarılabilen, yüksek oranda asit kararsız bir karboksil koruma grubudur.

OET

Etil ester, Etil esterlerin uzaklaştırılması için gereken sıkı koşullar nedeniyle, peptitlerin etil esterlerle değiştirilmesi, bunların lipofilitesini ve stabilitesini arttırabilir.

Ofm

9-Florenilmetil ester, DMF'de piperidin kullanılarak çıkarılabilen, baza kararsız bir karboksil koruma grubudur.

OHex

Heksil esterler: Etil esterlerin uzaklaştırılması için gereken sıkı koşullar nedeniyle, peptitlerin etil esterlerle değiştirilmesi, bunların lipofilitesini ve stabilitesini arttırabilir.

İslam

L-Otahidroindol-2-karboksilik asit (Oik), polar olmayan engellenmiş bir amino asittir. Bu prolinle ilişkili amino asidin polipeptit dizisine eklenmesi, peptidin konformasyonunu güçlü bir şekilde etkiler.

OMe

Metil esterler, sıvı faz sentezinde yarı kalıcı C-terminal koruma gruplarıdır ve reaktif peptid azidlerin öncüleri olan peptid hidrazidlere dönüştürülebilirler. Azit birleştirme, sıvı fazlı peptit sentezinde en popüler parça birleştirme yöntemi olmayı sürdürüyor.

OMpe (Sigara İçme)

3-Metilpent-3-il ester (OMpe), Fmoc bazlı katı fazlı peptid sentezinde (Fmoc-SPPS) aspartik asidin (Asp) karboksil grubunu korumak için sıklıkla kullanılan, asit kararsız bir karboksil koruma grubudur ).Sterik açıdan daha zorlu olan bu tert-bütil ester analoğu, baz katalizli asparagimid oluşumunu azaltmak için özel olarak geliştirildi.

ON P

Boc- veya Z-amino asitlerin orto-nitrofenil esterleri, peptit çözeltisi sentezinde kullanılan önceden aktifleştirilmiş türevlerdir.

Orn

Ornitin (Orn), üre döngüsü sırasında arginin'den üretilir ve ayrıca peptitlerde arginin bozunma ürünü olarak da gözlemlenebilir. Argininin guanidin kısmının asilasyonu yoluyla Orn oluşumu, peptit sentezinde yaygın bir yan reaksiyondur.

İşletim Sistemi

Hidroksisüksinimit ester (OSu, NHS olarak kısaltılır), peptit sentezinde, özellikle peptit modifikasyonunda yaygın olarak kullanılan önceden aktifleştirilmiş bir amino asit türevidir. OSu esterleri güvenlidir, sterik değildir, sulu sistemlerle uyumludur ve kullanımı kolaydır.

OtBu - t-Butil ester

Tert-butil ester, peptit sentezindeki amino asitler için asit kararsız bir karboksil koruma grubu.

ERDAL

4-aminobenzoik asit (para-aminobenzoik asit), Antikor-ilaç konjugat bağlayıcılarının sentezi için kullanılabilir. Örneğin Mal-PEG2-Val-Cit-PABA, parçalanabilir bir antikor ilaç konjugatı (ADC) bağlayıcısıdır.

PABC (Türkçe)

PABC (para-aminobenzil karbamat), antikor-ilaç konjugatlarının (ADC'ler) sentezinde bir bağlayıcı olarak kullanılan kimyasal bir bileşiktir. İlaçların antikorlara kontrollü bir şekilde bağlanmasını kolaylaştırarak kanser tedavilerinde ve diğer biyomedikal uygulamalarda hedefe yönelik ilaç dağıtımını sağlar. Örneğin Mc-Val-Cit-PABC-PNP, antikor-ilaç konjugatlarında (ADC'ler) kullanılan, katepsinle parçalanabilen bir bağlayıcıdır.

PAKAP

Hipofiz adenilat siklaz aktive edici polipeptit (PACAP), memeli beyninde belirgin bir şekilde eksprese edilen, yüksek oranda korunmuş bir nöropeptittir. Biyolojik etkilerini, reseptör etkileşimi yoluyla hücre içi siklik AMP seviyelerini artırarak gösterir.

Pam

Palmitoil, N terminaline veya yanına eklenen polar olmayan bir asil grubu. Palmitoilasyon aynı zamanda proteinlerin translasyon sonrası modifikasyonu olarak da gözlemlenmiştir.

PAM

Fenil asetamid metil reçinesi, özellikle Boc bazlı katı fazlı peptid sentezi (Boc-SPPS) için tasarlanmış bir reçinedir. Bu reçine üzerinde sentezlenen peptitler, HF bölünmesi kullanılarak serbest bırakılabilir.

Yük

Antikor-İlaç Konjugatlarında (ADC'ler), bağlayıcı, antikoru sitotoksik yüke bağlar. Yükün seçimi, ADC'lerin spesifik salınım mekanizmaları aracılığıyla tedaviyi hedef dokulara iletmedeki etkinliğini ve özgüllüğünü belirlediği için kritik öneme sahiptir.

Pbf (İngilizce)

2,2,4,6,7-Pentametildihidrobenzofuran-5-sülfonil (Pbf), Fmoc bazlı katı fazlı peptit sentezinde (Fmoc-SPPS) kullanılan tercih edilen guanidino koruma grubudur. Pmc'ye kıyasla biraz daha yüksek asit kararsızlığı sergiler.

Dolma kalem

Penisilamin, bir metil grubunun (-CH3) bir karboksilik asit (-COOH) ile ikame edilmesiyle karakterize edilen bir L-sistein analoğudur.

Peptit kendiliğinden montajı

Peptidlerin kendi kendine birleşmesi, peptitlerin dışarıdan müdahale olmaksızın doğal olarak kendilerini düzenli yapılar halinde düzenlemesidir. bu süreç, hidrojen bağı, hidrofobik etkileşimler, elektrostatik kuvvetler ve π-π istiflenmesi gibi kovalent olmayan etkileşimler tarafından yönlendirilir. Peptitlerin kendiliğinden birleşmesi, malzeme bilimi, biyoteknoloji ve tıpta uygulamaları olan lifler, küreler, tabakalar ve jeller dahil olmak üzere çeşitli nanoyapıların oluşumuna yol açabilir.

fenilak

Fenilasetil (Phenylac veya Phac), tipik olarak peptitlerin N terminaline bağlanan bir asil grubudur ve asetil (Ac) ile karşılaştırıldığında daha düşük polarite ile karakterize edilir. Peptitlerin kalıcı bir modifikasyonunu oluşturur.

Fransa

fenilglisin (Phg), glisin molekülündeki hidrojen atomunun yerine bir fenil grubunun geçtiği bir amino asit türevidir

PHİ

Peptid Histidin İzolösin (PHI), VIP ve sekretin ile ilgili bir domuz peptididir.

HSH

VIP ile ilişkili bir insan peptidi olan peptid histidin metiyonin (PHM).

Pİ

İzoelektrik nokta (pI), protein/peptidin net yükünün sıfır olduğu pH seviyesi olarak tanımlanır (Smoluch ve diğerleri, 2016).

PMC

2,2,5,7,8-Pentametilkroman-6-sülfonil (Pmc), Fmoc bazlı katı fazlı peptit sentezinde (Fmoc-SPPS) yaygın olarak kullanılan bir guanidinil koruma grubudur. Pbf'ye kıyasla biraz daha az asit duyarlılığına sahip olduğu belirtiliyor.

Pna

Bir kromofor olan p-nitroanilin, tipik olarak karboksipeptidaz substratlarının C terminaline konjuge edilir. Serbest kalan p-nitroanilinin emilimi genellikle 405 veya 410 nm civarındaki dalga boylarında ölçülür.

Pra

L-Propargilglisin (Pra), mikroorganizmalar tarafından üretilir. Üçlü bağ yapısıyla karakterize edilen bu amino asit, "tıklama kimyası" reaksiyonlarına girebilen peptitlerin sentezlenmesi için temel bir birim olarak kabul edilmekte ve bu alanda büyük ilgi görmektedir.

pTH

Paratiroid hormonu (PTH), paratiroid bezleri tarafından salgılanan ve hücre dışı sıvıda kalsiyum ve fosfor homeostazisinin korunmasında hayati önem taşıyan bir peptit hormonudur.

PTM'ler

Proteinlerin translasyon sonrası modifikasyonları (PTM'ler), fonksiyonel gruplar veya proteinler ekler, düzenleyici alt birimleri keser veya proteinlerin tamamını parçalar. Fosforilasyon, glikosilasyon, metilasyon, asetilasyon, lipidasyon, her yerde bulunma, nitrosilasyon ve proteoliz gibi bu değişiklikler hücrelerin normal şekilde ve hastalık sırasında nasıl çalıştığını etkiler. PTM'leri anlamak, temel araştırma ve yeni tedaviler bulmak için çok önemlidir.

Pir

Pgl, Glp, pGlu veya gibi kısaltmalarla da bilinen piroglütamik asit

Pz (İngilizce)

fenilazobenzilmetoksikarbonil, peptit sentezinde kullanılan, katalitik hidrojenasyon veya güçlü asit ile bölünebilen kromoforik bir N-koruyucu gruptur. 229 nm, 320 nm ve 441 nm'de maksimum absorpsiyon dalga boylarını sergiler.

Söndürücü çiftleri

Bir söndürücü çifti, bir floresan molekülü (florofor) ve floresans bazlı araştırma ve analizlerde kullanılan bir söndürücü molekülden oluşur. Söndürücü, florofor tarafından yayılan ışığı emerek floresansını azaltır. Florofor ve söndürücü biyokimyasal bir reaksiyon yoluyla ayrıldığında floresans sinyali artar. Bu, araştırmacıların gerçek zamanlı değişiklikleri ve etkileşimleri ölçmesine olanak tanır. Bu teknik, gerçek zamanlı PCR, moleküler problar ve FRET (Förster Rezonans Enerji Transferi) analizleri gibi uygulamalarda yaygın olarak kullanılır.

Radyoligandlar

Flor-18, dokulardaki glikoz metabolizmasını değerlendirmek için PET görüntülemede yaygın olarak kullanılan bir radyoliganddır ve yaygın olarak kanser teşhisinde ve beyin görüntülemede kullanılır.

Rastgele peptit kütüphanesi

Rastgele bir peptit kütüphanesi, rastgele oluşturulan birçok kısa peptit dizisinin bir koleksiyonudur. Kütüphanedeki her bir peptit, rastgele belirlenmiş dizilere sahip belirli sayıda amino asit içerir ve bu da çok çeşitli peptit molekülleri oluşturur. Araştırmacılar bu kütüphaneleri belirli özelliklere, biyolojik aktivitelere veya hedef moleküllerle etkileşimlere sahip peptitleri taramak için kullanır. Özellikle ilaç keşfi, immünoloji ve protein-protein etkileşimleri araştırmalarında faydalıdırlar; yeni terapötiklerin belirlenmesine ve karmaşık biyolojik süreçlerin anlaşılmasına yardımcı olurlar.

Kalıntı(lar)

Bir kalıntı, bir peptit veya protein içindeki ayrı bir amino asittir. Amino asitler peptit bağları aracılığıyla bir araya gelerek bu zincirleri oluştururken, her bir amino asit birimine bir kalıntı adı verilir. Bu terimin kullanılmasının nedeni, peptit bağının oluşumu sırasında her amino asidin bir su molekülünü (H2O) kaybetmesi ve geride kalıntı adı verilen şeyi bırakmasıdır.

Reçine

Reçine, katı fazlı peptid sentezinde (SPPS) amino asitlerin sürekli eklenmesi için katı bir destek olarak kullanılan çözünmeyen bir polimerdir. Reçine boncukları, başlangıçtaki amino asitlerin kovalent olarak bağlandığı stabil ve inert bir yüzey sağlayarak peptid zincirinin kalıntı bazında oluşturulmasına olanak tanır.

Rodamin B

Rodamin B, genellikle 540-570 nm civarında bir uyarılma dalga boyuna ve 560-580 nm yayılan bir ışık aralığına sahip, parlak pembe ila kırmızı bir boyadır. Genellikle peptidin N-terminal amino grubu yoluyla peptid dizisine konjuge edilir.

RP-HPLC Serisi

Ters fazlı yüksek performanslı sıvı kromatografisi.

SAR'lar

Yapı-Aktivite İlişkisi (SAR) ilaçları, bir ilacın kimyasal yapısı ile biyolojik aktivitesi arasındaki ilişki incelenerek geliştirilir.

Sar

Sarkosin, en basit N-alkillenmiş amino asittir.

SDMA (Demokratik Güç)

Simetrik dimetilarginin(SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (simetrik), simetrik dimetilarginin içeren peptitlerin sentezi için doğrudan kullanılabilir.

SPPS'ler

Katı faz peptit sentezi (SPPS), peptitlerin, korumalı amino asitlerin sırayla eklenmesiyle katı bir destek veya reçine üzerinde adım adım birleştirildiği peptitlerin kimyasal sentezi için bir yöntemdir. SPPS iki stratejiyi kapsar: N-amino grubu koruma gruplarının (Fmoc veya Boc) ve yan zincir koruma gruplarının seçiminde farklılık gösteren Fmoc-SPPS ve Boc-SPPS. Seçilen N-amino koruma grubunun tipi, yan zincir koruma stratejisini ve peptidin reçineden son bölünmesine yönelik koşulları belirler.

Sta

Sta olarak kısaltılan statin, peptit mimetiklerinin tasarımında, özellikle proteaz inhibitörlerinin sentezinde sıklıkla kullanılan, protein olmayan bir amino asittir.

StBu

Tert-Butylthio (StBu), fosfin indirgemesiyle parçalanan ve Boc-SPPS ile uyumlu olan bir S-koruyucu gruptur.

Çok iyi

Süksinil, deaminlenmiş aspartata karşılık gelen ve tipik olarak karboksipeptidaz substratlarına dahil edilen polar bir N-terminal modifikasyonudur.

TAŞ -TAN

TMR olarak da kısaltılan TAMRA, bir amino grubuna bağlanabilen bir florofordur. FRET yüzeyleri için sıklıkla FAM ile birlikte kullanılır. TAMRA'nın uyarılma dalga boyu 485 nm ve emisyon dalga boyu 535 nm'dir.

tBu

Tert-butil, alkoller ve fenoller için yaygın olarak kullanılan, trifloroasetik asit (TFA) kullanılarak bölünebilen, asit kararsız bir koruma grubudur.

ÇAY

Trietilamonyum fosfat, ters fazlı HPLC mobil fazlarında kullanılan bir tampondur.

TFA (Radyo Frekansı

Fmoc-SPPS'deki reçineden peptit bölünmesi ve tBu'dan türetilmiş koruma gruplarının çıkarılması için trifloroasetik asit (TFA) kullanıldı.

TFMSA Gazetesi

Triflorometansülfonik asit (TFMSA), TFA'dan daha güçlü bir asittir. TFMSA, Boc-SPPS stratejisinin son bölünme adımı için yüksek derecede toksik HF'ye daha güvenli bir alternatif olarak kullanılabilir.

Öğr.

L-tert-lösin (Tle), -helisleri dengesizleştiren sterik olarak zorlu yan zincirlere sahip, polar olmayan bir amino asittir.

Kalabalık

2,4,6-Trimetoksibenzil, Fmoc-SPPS'de kullanılan, asitte kararsız bir Asn ve Gln amid koruma grubudur.

Yapılacaklar

Tosil, Boc-SPPS'de guanidin ve imidazol için koruma grubu olarak kullanılır ve Na/NH3 ile uzaklaştırılabilir.

Trt

Tritil (Trt), Fmoc-SPPS'deki Asn, Cys, Gln ve His kalıntıları için kullanılan asit kararsız bir koruma grubudur. Trifloroasetik asit (TFA) kullanılarak seçici olarak uzaklaştırılabilir.

Beyaz Liyofilize toz

Saf peptitler tipik olarak dondurularak kurutulduktan sonra beyaz bir toz halinde bulunur.

vip

Vazoaktif bağırsak peptidi (VIP), glukagon-ghrelin-sekretin peptid süper ailesine ait bir 28-amino asit peptididir.

Ertuğrul

9-Ksanhidril (Xan), Boc-SPPS'deki Asn ve Gln kalıntıları için kullanılan, asit kararsız bir amid koruma grubudur. Xan, TFA kullanılarak seçici olarak çıkarılabilir.

Sarı Liyofilize toz

Peptit FAM fluoresein ile etiketlendiğinde liyofilize toz tipik olarak sarı bir görünüm sergiler.

Z veya Cbz olarak kısaltılan Z-benziloksikarbonil, peptid sentezinde amino koruyucu grup olarak kullanılır. Hidrojenoliz veya saf HF veya HBr/asetik asit gibi güçlü asitler kullanılarak çıkarılabilir.

Sözlük

Telefon

Adres

E-posta

Sözlük