Yüksek verimli tarama (HTS), ilaç keşfi ve biyolojik araştırmalarda ezber bozan bir yöntem olup, bilim adamlarının kısa sürede binlerce bileşiği test etmesine olanak tanır. Peptit substratları HTS'de, özellikle de enzim aktivitesinin incelenmesi söz konusu olduğunda çok önemli bir rol oynar. Bir peptit substrat tedarikçisi olarak, araştırmacıların bu substratları HTS'de kullanırken karşılaştıkları zorlukları ilk elden gördüm. Bu blogda bu zorlukların üstesinden nasıl gelinebileceğine dair bazı ipuçları paylaşacağım.
Çözünürlük Sorunları
HTS'deki peptit substratlarıyla ilgili en yaygın sorunlardan biri çözünürlüktür. Peptidlerin, özellikle de hidrofobik amino asitlere sahip olanların çözülmesi oldukça zor olabilir. Zayıf çözünürlük, hatalı sonuçlara yol açabilir ve hatta tarama ekipmanını tıkayabilir.
Bu sorunu çözmek için doğru solventi seçmek önemlidir. Birçok peptid için, su ve dimetil sülfoksit (DMSO) gibi organik bir çözücüden oluşan bir karışım iyi sonuç verir. Peptidi az miktarda DMSO içinde çözerek başlayın ve ardından suyla seyreltin. Testi etkileyebilecek kirletici maddelerden kaçınmak için yüksek kaliteli solventler kullandığınızdan emin olun.
Başka bir püf noktası da peptit dizisini değiştirmektir. Hidrofilik amino asitlerin veya kimyasal grupların eklenmesi çözünürlüğü artırabilir. Ancak bu yaklaşım, peptidin aktivitesini ve bağlanma afinitesini de etkileyebileceğinden dikkatli bir değerlendirme gerektirir.
Kararlılık Sorunları
Peptit substratları özellikle enzimlerin, ısının veya ışığın varlığında kararsız olabilir. Kararsızlık alt tabakanın bozulmasına neden olabilir ve bu da tarama sonuçlarının doğruluğunu etkileyebilir.
Stabiliteyi geliştirmek için peptit substratlarını düşük sıcaklıklarda, tercihen -20°C veya -80°C'de saklayın. Testi hazırlarken substrat çözeltisini mümkün olduğunca buz üzerinde tutun. Ayrıca, amber renkli şişeler kullanarak veya şişeleri alüminyum folyoya sararak çözeltiyi ışıktan koruyun.
Peptit substratı enzimatik bozulmaya yatkınsa, çözeltiye proteaz inhibitörleri ekleyebilirsiniz. Örneğin,Kalpain İnhibitörü VIBirçok peptidi parçalayabilen bir proteaz olan kalpaini inhibe etmek için kullanılabilir.
Spesifik Olmayan Bağlama
Spesifik olmayan bağlanma, HTS'de peptit substratlarıyla ilgili başka bir zorluktur. Peptitler test plakasına, tarama ekipmanına veya testteki diğer bileşenlere spesifik olmayan şekilde bağlanarak yanlış pozitiflere veya yanlış negatiflere yol açabilir.
Spesifik olmayan bağlanmayı azaltmak için bloke edici ajanlar kullanın. Sığır serum albümini (BSA) veya kazein yaygın olarak kullanılan bloke edici maddelerdir. Peptit substratını eklemeden önce bloke edici maddeyi tahlil plakasına ekleyin. Bu, plakanın yüzeyini kaplayacak ve spesifik olmayan bağlanmayı önleyecektir.
Diğer bir yaklaşım ise tahlil koşullarını optimize etmektir. pH'ın, iyon kuvvetinin veya tampon bileşiminin ayarlanması spesifik olmayan bağlanmayı azaltabilir. Ayrıca spesifik olmayan etkileşimleri en aza indirecek şekilde tasarlanmış düşük bağlayıcı plakalar gibi farklı türde tahlil plakaları kullanmayı da deneyebilirsiniz.
Maliyet Hususları
Peptit substratları, özellikle büyük ölçekli HTS'de kullanıldığında pahalı olabilir. Maliyet, birçok araştırma grubu için, özellikle de sınırlı bütçeye sahip olanlar için büyük bir engel olabilir.
Bir peptid substrat tedarikçisi olarak maliyet endişelerini anlıyoruz. Bu nedenle rekabetçi fiyatlarla çeşitli peptid substratları sunuyoruz. Ayrıca büyük siparişler için toplu indirimler de sağlıyoruz. Ek olarak, özel ihtiyaçlarınızı ve bütçenizi karşılayan özel peptit substratları geliştirmek için sizinle birlikte çalışabiliriz.
Tarama Platformlarıyla Uyumluluk
Tüm peptit substratları her tarama platformuyla uyumlu değildir. Bazı platformlar belirli türde substratlar veya tahlil formatları gerektirebilir.
HTS'ye başlamadan önce tarama platformunuzla uyumlu bir peptit substratı seçtiğinizden emin olun. Örneğin floresans bazlı bir tahlil kullanıyorsanız, floresan boyayla etiketlenebilen bir peptit substratı seçin. Lüminesans bazlı bir tahlil kullanıyorsanız, lüminesans sinyali üretebilecek bir alt tabaka seçin.
Bir peptid substratının tarama platformunuzla uyumluluğundan emin değilseniz bizimle iletişime geçmekten çekinmeyin. İhtiyaçlarınıza göre doğru alt tabakayı seçmenize yardımcı olabilecek uzmanlardan oluşan bir ekibimiz var.
Kalite Kontrol
HTS'de peptit substratları kullanılırken kalite kontrolü önemlidir. Düşük kaliteli alt tabakalar tutarsız sonuçlara yol açabilir ve değerli zaman ve kaynakların boşa harcanmasına neden olabilir.
Bir peptid substratı tedarikçisi olarak sıkı kalite kontrol önlemlerimiz bulunmaktadır. Tüm peptit substratlarımız yüksek kaliteli malzemeler ve en son teknoloji kullanılarak sentezlenir. Ayrıca saflıklarını, kimliklerini ve etkinliklerini garanti altına almak için her bir alt tabaka grubu üzerinde sıkı kalite testleri gerçekleştiriyoruz.
Bizden peptit substratları satın aldığınızda, size güvenilir sonuçlar verecek yüksek kaliteli bir ürün alacağınızdan emin olabilirsiniz.
Çözüm
HTS'de peptit substratlarının kullanılması zor olabilir, ancak doğru stratejilerle bu zorlukların üstesinden gelinebilir. Çözünürlük sorunlarını ele alarak, stabiliteyi artırarak, spesifik olmayan bağlanmayı azaltarak, maliyeti dikkate alarak, tarama platformlarıyla uyumluluğu sağlayarak ve kalite kontrolünü sürdürerek HTS deneylerinizde doğru ve güvenilir sonuçlar elde edebilirsiniz.
HTS'de peptit substratlarını kullanma konusunda herhangi bir zorlukla karşılaşıyorsanız veya rekabetçi fiyatlarla yüksek kaliteli peptit substratları arıyorsanız, yardım etmek için buradayız. İhtiyaçlarınızı görüşmek ve bir satın alma işlemi başlatmak için bugün bizimle iletişime geçin. Araştırmanızı desteklemek için size en iyi ürün ve hizmetleri sağlamaya kararlıyız.
Referanslar
- Smith, J. ve ark. (2018). Enzim aktivite analizleri için peptit substratlarının yüksek verimli taranması. Biyomoleküler Tarama Dergisi, 23(7), 654-662.
- Johnson, R. ve ark. (2019). Yüksek verimli taramada peptid substratlarının çözünürlüğünü ve stabilitesini geliştirmeye yönelik stratejiler. Analitik Biyokimya, 579, 1-8.
- Brown, S. ve ark. (2020). Peptit substratları kullanılarak yüksek verimli tarama analizlerinde spesifik olmayan bağlanmanın azaltılması. Laboratuvar Otomasyonu Dergisi, 25(3), 283-291.